HALO 是Indica Labs的旗艦平臺，可以適應(yīng)任何組織病理圖像的分析應(yīng)用，并提供逐個細(xì)胞和所選區(qū)域的分析結(jié)果，是HE染色、免疫組化、免疫熒光染色、DNA/RAN分子原位雜交以及FISH等切片病理圖像分析的理想選擇。

HALO能夠適應(yīng)您任何的組織病理圖像的分析需求。在免疫腫瘤學(xué)、腫瘤學(xué)、移植科學(xué)、神經(jīng)科學(xué)、眼科、代謝和呼吸等領(lǐng)域有廣泛的應(yīng)用。

弗瑞思提供HALO軟件可實現(xiàn)的病理圖像分析服務(wù)，本文旨在介紹HALO在免疫病理技術(shù)中的應(yīng)用。

1、組織分型

HALO軟件利用機器基于隨機森林算法，根據(jù)病理組織圖像的顏色、紋理、光密度以及其和周圍環(huán)境特征來識別不同組織類型。通過快讀的訓(xùn)練，可迅速的對整張切片或批量切片進行不同組織的分型。

2、多色熒光免疫組化分析

HALO可同時分析任何細(xì)胞單位（細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)和/膜）中無限數(shù)量的熒光標(biāo)記，并且可以根據(jù)標(biāo)記陽性來定義特定的細(xì)胞表型，因此非常適合應(yīng)用于免疫腫瘤學(xué)，因為在免疫腫瘤學(xué)中需要多個標(biāo)記來描述組織內(nèi)不同的免疫和腫瘤細(xì)胞群。

案例中，熒光圖像顯示了5種顏色——膜結(jié)合腫瘤標(biāo)記物為紅色，細(xì)胞質(zhì)標(biāo)記物為青色，兩個不同的核標(biāo)記物為綠色和玫紅色，以及藍(lán)色的DAPI復(fù)染。在標(biāo)記圖像中，細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞膜會根據(jù)每個標(biāo)記的細(xì)胞陽性率進行著色。所有標(biāo)記為陰性的細(xì)胞為黑色，多個標(biāo)記為陽性的細(xì)胞為白色，單個標(biāo)記為陽性的細(xì)胞則按該標(biāo)記的顏色著色。當(dāng)與空間分析一起使用時，還可以實現(xiàn)對這些細(xì)胞群的空間關(guān)系的進一步探索。

3、空間位置關(guān)系分析

空間分析適用于免疫腫瘤學(xué)領(lǐng)域的研究，可用于識別目標(biāo)、細(xì)胞和/或某些特征在單個組織或連續(xù)切片上的鄰近性和相對空間分布。

腫瘤浸潤分析：對組織目標(biāo)物的空間分布、鄰近關(guān)系等行統(tǒng)計和定量。標(biāo)記腫瘤邊界，對邊界內(nèi)外指定范圍內(nèi)的免疫細(xì)胞分布進行定量統(tǒng)計。細(xì)胞與組織區(qū)域之間可以通過比較組織邊界不同距離內(nèi)細(xì)胞的數(shù)量和密度變化來體現(xiàn)

鄰近分析：對組織目標(biāo)物的空間分布、鄰近關(guān)系等行統(tǒng)計和定量。統(tǒng)計一類細(xì)胞指定距離內(nèi)，其他類型細(xì)胞數(shù)量通過比較不同樣本之間的鄰近度或者近距離，可以得知不同樣本之間兩種細(xì)胞的密集分布關(guān)系。

組織芯片分析：將芯片切割后對每個點進行單獨分析，可與其他所有模塊聯(lián)用分析相應(yīng)內(nèi)容。芯片自由分割，拆分所有樣本點。所有數(shù)據(jù)都可生成熱圖。對每個點單獨分析。