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圖像來源:建議同批次染色結果進行定量分析比較,避免批次效應帶來的影響;
組織識別:可提供病理全組織切片分析/手動局部區(qū)域/組織分型多種區(qū)域框選分析;
細胞核識別:DAPI復染細胞核用于識別整張病理切片細胞所在的位置;
陽性表達識別:根據特異性蛋白定位(膜/胞漿/核/分泌性;可按陽性細胞數定量也可按陽性表達面積定量)及強度進行閾值調整,根據批量實際效果設置弱中強陽性閾值,實時觀察效果,確認適用于批量分析,提供單陽/雙陽/三陽性/等共表達多維度數據量化結果;
空間特征分析:根據具體情況提供2種空間特征分析方式,一種有明顯邊界,手動確認邊界或聯合組織分型確認邊界分析邊界內外某類細胞分布特征,第二種以某類細胞為圓形,計算一定范圍內兩類細胞之間的距離,觀察細胞之前有無相關性、對用藥以及預后的影響。
數據輸出:數據輸出主要以EXCEL表為主以及分析過程中產生的效果圖,總細胞數量/陽性細胞數量/陽性率/弱中強陽細胞數/弱中強陽性細胞率/一定范圍內兩類細胞之間的平均距離,并把常見統(tǒng)計指標單獨分類列出。
交付結果:HALO分析所有原始數據及常見統(tǒng)計指標單獨列出,所有列表readme示例文檔,自動化報告,有個性化分析需求的一并上傳服務器交付。
圖像來源:建議同批次染色結果進行定量分析比較,避免批次效應帶來的影響;
組織識別:可提供病理全組織切片分析/手動局部區(qū)域/組織分型多種區(qū)域框選分析;
細胞核識別:DAPI復染細胞核用于識別整張病理切片細胞所在的位置;
陽性表達識別:根據特異性蛋白定位(膜/胞漿/核/分泌性;可按陽性細胞數定量也可按陽性表達面積定量)及強度進行閾值調整,根據批量實際效果設置弱中強陽性閾值,實時觀察效果,確認適用于批量分析,提供單陽/雙陽/三陽性/等共表達多維度數據量化結果;
空間特征分析:根據具體情況提供2種空間特征分析方式,一種有明顯邊界,手動確認邊界或聯合組織分型確認邊界分析邊界內外某類細胞分布特征,第二種以某類細胞為圓形,計算一定范圍內兩類細胞之間的距離,觀察細胞之前有無相關性、對用藥以及預后的影響。
數據輸出:數據輸出主要以EXCEL表為主以及分析過程中產生的效果圖,總細胞數量/陽性細胞數量/陽性率/弱中強陽細胞數/弱中強陽性細胞率/一定范圍內兩類細胞之間的平均距離,并把常見統(tǒng)計指標單獨分類列出。
交付結果:HALO分析所有原始數據及常見統(tǒng)計指標單獨列出,所有列表readme示例文檔,自動化報告,有個性化分析需求的一并上傳服務器交付。