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圖像來源:建議同批次染色結(jié)果進(jìn)行定量分析比較,避免批次效應(yīng)帶來的影響;
組織識別:可提供病理全組織切片分析/手動(dòng)局部區(qū)域/組織分型多種區(qū)域框選分析;
細(xì)胞核識別:DAPI復(fù)染細(xì)胞核用于識別整張病理切片細(xì)胞所在的位置;
陽性表達(dá)識別:根據(jù)特異性蛋白定位(膜/胞漿/核/分泌性;可按陽性細(xì)胞數(shù)定量也可按陽性表達(dá)面積定量)及強(qiáng)度進(jìn)行閾值調(diào)整,根據(jù)批量實(shí)際效果設(shè)置弱中強(qiáng)陽性閾值,實(shí)時(shí)觀察效果,確認(rèn)適用于批量分析,提供單陽/雙陽/三陽性/等共表達(dá)多維度數(shù)據(jù)量化結(jié)果;
空間特征分析:根據(jù)具體情況提供2種空間特征分析方式,一種有明顯邊界,手動(dòng)確認(rèn)邊界或聯(lián)合組織分型確認(rèn)邊界分析邊界內(nèi)外某類細(xì)胞分布特征,第二種以某類細(xì)胞為圓形,計(jì)算一定范圍內(nèi)兩類細(xì)胞之間的距離,觀察細(xì)胞之前有無相關(guān)性、對用藥以及預(yù)后的影響。
數(shù)據(jù)輸出:數(shù)據(jù)輸出主要以EXCEL表為主以及分析過程中產(chǎn)生的效果圖,總細(xì)胞數(shù)量/陽性細(xì)胞數(shù)量/陽性率/弱中強(qiáng)陽細(xì)胞數(shù)/弱中強(qiáng)陽性細(xì)胞率/一定范圍內(nèi)兩類細(xì)胞之間的平均距離,并把常見統(tǒng)計(jì)指標(biāo)單獨(dú)分類列出。
交付結(jié)果:HALO分析所有原始數(shù)據(jù)及常見統(tǒng)計(jì)指標(biāo)單獨(dú)列出,所有列表readme示例文檔,自動(dòng)化報(bào)告,有個(gè)性化分析需求的一并上傳服務(wù)器交付。
圖像來源:建議同批次染色結(jié)果進(jìn)行定量分析比較,避免批次效應(yīng)帶來的影響;
組織識別:可提供病理全組織切片分析/手動(dòng)局部區(qū)域/組織分型多種區(qū)域框選分析;
細(xì)胞核識別:DAPI復(fù)染細(xì)胞核用于識別整張病理切片細(xì)胞所在的位置;
陽性表達(dá)識別:根據(jù)特異性蛋白定位(膜/胞漿/核/分泌性;可按陽性細(xì)胞數(shù)定量也可按陽性表達(dá)面積定量)及強(qiáng)度進(jìn)行閾值調(diào)整,根據(jù)批量實(shí)際效果設(shè)置弱中強(qiáng)陽性閾值,實(shí)時(shí)觀察效果,確認(rèn)適用于批量分析,提供單陽/雙陽/三陽性/等共表達(dá)多維度數(shù)據(jù)量化結(jié)果;
空間特征分析:根據(jù)具體情況提供2種空間特征分析方式,一種有明顯邊界,手動(dòng)確認(rèn)邊界或聯(lián)合組織分型確認(rèn)邊界分析邊界內(nèi)外某類細(xì)胞分布特征,第二種以某類細(xì)胞為圓形,計(jì)算一定范圍內(nèi)兩類細(xì)胞之間的距離,觀察細(xì)胞之前有無相關(guān)性、對用藥以及預(yù)后的影響。
數(shù)據(jù)輸出:數(shù)據(jù)輸出主要以EXCEL表為主以及分析過程中產(chǎn)生的效果圖,總細(xì)胞數(shù)量/陽性細(xì)胞數(shù)量/陽性率/弱中強(qiáng)陽細(xì)胞數(shù)/弱中強(qiáng)陽性細(xì)胞率/一定范圍內(nèi)兩類細(xì)胞之間的平均距離,并把常見統(tǒng)計(jì)指標(biāo)單獨(dú)分類列出。
交付結(jié)果:HALO分析所有原始數(shù)據(jù)及常見統(tǒng)計(jì)指標(biāo)單獨(dú)列出,所有列表readme示例文檔,自動(dòng)化報(bào)告,有個(gè)性化分析需求的一并上傳服務(wù)器交付。